根据《方案》，定点医疗机构医疗费用实行总额控制，根据各定点医疗机构提供的近三年住院医疗费用情况和新一年度待遇支付费用总额测算情况，按照定点医疗机构不同级别、类别、定点服务范围、有效服务量和承担的首诊、转诊任务等因素，确定定点医疗机构一年的医疗费用总额。
该《方案》明确，对公立医疗卫生机构的运行成本，通过服务收费和财政补助给予补偿。着力体现医务人员技术劳务价值，合理确定医务人员收入水平，并建立动态调整机制，逐步提高人员支出占医院支出的比例。医疗卫生机构提供的医疗服务价格，按扣除政府补助后的成本制定。实行药品零差率销售后，药品收入不再作为医疗卫生机构经费的补偿渠道，不得接受药品折扣。
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